之后，冯雪峰作为中共中央特派员，到上海负责整理、恢复、重建上海党组织和统战工作。这期间，冯雪峰沟通了中国共产党与鲁迅的关系，使鲁迅加深对中国共产党和毛泽东的了解。冯雪峰将从鲁迅处得来的方志敏烈士的信抄送给党中央，将《可爱的中国》和《清贫》两篇烈士手稿托人妥善保管，并找到毛泽东失散多年的两个儿子——毛岸英和毛岸青，派人将他们经巴黎转送到莫斯科。

1937年12月冯雪峰回到神坛村，创作反映长征的长篇小说《卢代之死》（后散佚）。1941年2月，遭国民党顽固派逮捕，囚于上饶集中营，但他坚贞不屈，坚持狱中斗争。后在毛泽东指示下，由党组织营救出狱。1943年至1949年，根据周恩来指示，冯雪峰先后在重庆、上海从事统战和文化工作。建国后任华东军政委员会委员、上海市人民政府委员、上海市文艺工作者协会主席、上海市文联副主席、鲁迅著作编刊社社长兼总编、人民文学出版社社长兼总编、《文艺报》主编、中国作协党组书记、副主席。1976年1月病逝于北京。

冯雪峰一生著述颇丰，所涉题材多样，有杂文、小说、诗歌、寓言、电影剧本、文学评论、译著等多种，是优秀的文艺理论家、作家、诗人和鲁迅研究专家，为中国革命及文艺事业的发展作出了重要贡献。